u_gen_hits93

Gene list

Wadsworth clusters

Rajewsky clusters

Score	Distance to operon	Sense	Operon structure
0.662626	214	-	fliA b1922 .. 10 .. fliZ b1921 .. 88 .. fliY b1920 .. 9 .. yedO b1919 .. 15 .. yecS b1918 .. -3 .. yecC b1917
0.472862	190	+	ydbA_1 b1401
0.426301	188	+	ydbA_1 b1401
0.392218	105	+	leuO b0076
0.391396	432	+	carA b0032 .. 18 .. carB b0033
0.285522	132	+	pdhR b0113
0.271945	212	-	pitB b2987
0.263660	121	-	b2760 b2760 .. -7 .. ygcK b2759 .. 13 .. b2758 b2758 .. -3 .. b2757 b2757 .. -13 .. b2756 b2756 .. 16 .. b2755 b2755 .. -64 .. ygbF b2754
0.261542	227	+	sbp b3917 .. 107 .. cdh b3918
0.251045	231	-	yggB b2924 .. 139 .. yggA b2923 .. 93 .. yggE b2922
0.249659	208	-	pitB b2987
0.235734	61	+	ycbW b0946
0.217189	130	+	fucP b2801 .. 33 .. fucI b2802 .. 79 .. fucK b2803 .. 2 .. fucU b2804 .. 58 .. fucR b2805
0.201614	222	+	tauA b0365 .. 13 .. tauB b0366 .. -3 .. tauC b0367 .. -3 .. tauD b0368
0.189139	166	+	b2853 b2853 .. 143 .. b2854 b2854
0.175060	51	+	araC b0064 .. 86 .. yabI b0065
0.162833	46	+	rpmH b3703 .. 17 .. rnpA b3704
0.152886	169	-	b2856 b2856 .. 31 .. ygeK b2855
0.146533	123	+	rhsC b0700 .. -406 .. b0701 b0701
0.136862	107	+	leuO b0076
0.135417	156	-	b1498 b1498 .. 37 .. b1497 b1497
0.134878	69	-	ompT b0565
0.132636	163	+	yhaI b3104
0.132489	178	+	atoD b2221 .. 0 .. atoA b2222 .. -3 .. atoE b2223 .. 31 .. atoB b2224
0.131376	119	+	ung b2580
0.129938	99	+	yqeI b2847 .. -19 .. yqeJ b2848
0.126160	53	+	ybhM b0787
0.123579	215	+	uspA b3495
0.119636	58	-	gnd b2029
0.117302	142	+	yrbL b3207
0.117028	129	+	ynaJ b1332
0.114859	113	+	yicE b3654 .. 121 .. yicH b3655
0.113839	60	+	yeaV b1801 .. 32 .. yeaW b1802 .. 56 .. yeaX b1803
0.113683	64	-	sseB b2522
0.113320	276	-	ompF b0929
0.111852	184	+	proB b0242 .. 12 .. proA b0243
0.110796	314	-	b2760 b2760 .. -7 .. ygcK b2759 .. 13 .. b2758 b2758 .. -3 .. b2757 b2757 .. -13 .. b2756 b2756 .. 16 .. b2755 b2755 .. -64 .. ygbF b2754
0.109786	218	+	araC b0064 .. 86 .. yabI b0065
0.106375	335	+	hyaA b0972 .. -3 .. hyaB b0973 .. 19 .. hyaC b0974 .. -3 .. hyaD b0975 .. -3 .. hyaE b0976 .. -3 .. hyaF b0977 .. 134 .. appC b0978 .. 12 .. appB b0979
0.105126	131	+	ybgI b0710 .. 23 .. ybgJ b0711 .. -6 .. ybgK b0712 .. -10 .. ybgL b0713 .. 36 .. nei b0714
0.103552	140	+	ygfZ b2898
0.103380	96	+	ylcB b0572
0.102368	33	+	yjhB b4279 .. -3 .. yjhC b4280
0.101639	84	+	mdaB b3028 .. 31 .. ygiN b3029
0.100391	119	-	b2760 b2760 .. -7 .. ygcK b2759 .. 13 .. b2758 b2758 .. -3 .. b2757 b2757 .. -13 .. b2756 b2756 .. 16 .. b2755 b2755 .. -64 .. ygbF b2754
0.099454	234	+	yhaG b3128 .. 149 .. sohA b3129 .. 0 .. yhaV b3130
0.098951	114	+	b2736 b2736 .. -3 .. b2737 b2737 .. 92 .. ygbL b2738 .. 5 .. ygbM b2739 .. 89 .. b2740 b2740
0.098940	69	+	yeiH b2158 .. 74 .. nfo b2159 .. 3 .. yeiI b2160
0.094511	171	-	b0805 b0805 .. 6 .. ybiX b0804 .. 74 .. ybiI b0803
0.092739	116	+	leuO b0076
0.092269	161	-	glmU b3730
0.091047	177	+	yhhY b3441
0.090608	289	+	gltF b3214
0.089534	10	-	atpF b3736 .. 15 .. atpH b3735 .. 13 .. atpA b3734 .. 51 .. atpG b3733 .. 27 .. atpD b3732 .. 21 .. atpC b3731
0.089460	217	+	rhsD b0497 .. 40 .. ybbC b0498 .. 0 .. b0499 b0499 .. -19 .. ybbD b0500 .. 39 .. b0501 b0501
0.088735	216	+	hdeD b3511
0.087140	58	+	yhiS b3504
0.086825	8	+	yicG b3646
0.085913	94	-	yiaY b3589 .. 75 .. aldB b3588
0.085090	15	-	yjcH b4068 .. -3 .. yjcG b4067
0.084444	14	-	xapR b2405
0.083729	106	-	kduI b2843 .. 30 .. kduD b2842
0.083096	14	-	yaeH b0163
0.082677	214	-	ytfL b4218
0.082114	53	+	yjfI b4181 .. 19 .. yjfJ b4182 .. 51 .. yjfK b4183 .. 18 .. yjfL b4184 .. 10 .. yjfM b4185 .. 3 .. yjfC b4186 .. 69 .. aidB b4187
0.081469	114	+	b1450 b1450
0.080948	237	+	yjjQ b4365 .. -42 .. bglJ b4366
0.080568	334	+	sdhC b0721 .. -6 .. sdhD b0722 .. 0 .. sdhA b0723 .. 16 .. sdhB b0724 .. 59 .. b0725 b0725 .. -18 .. sucA b0726 .. 15 .. sucB b0727
0.080482	336	+	fadL b2344
0.080086	189	+	tyrB b4054
0.079909	92	-	yagM b0279 .. 27 .. yagL b0278
0.079765	83	-	yddA b1496 .. 38 .. yddB b1495 .. 45 .. pqqL b1494
0.078703	16	-	b2339 b2339 .. 82 .. yfcU b2338 .. 13 .. b2337 b2337 .. 20 .. yfcS b2336 .. 0 .. b2335 b2335 .. -3 .. b2334 b2334 .. -3 .. b2333 b2333 .. -13 .. b2332 b2332
0.078052	288	-	focA b0904 .. 55 .. pflB b0903
0.077263	391	+	b1667 b1667 .. 126 .. b1668 b1668
0.076924	134	+	pdhR b0113
0.075111	75	-	yiaW b3587 .. 6 .. yiaV b3586
0.074397	161	+	yagG b0270 .. 12 .. yagH b0271
0.074085	103	+	yheE b3324 .. -28 .. yheF b3325 .. 10 .. yheG b3326 .. -3 .. hofF b3327 .. 10 .. hofG b3328 .. 8 .. hofH b3329 .. -42 .. yheH b3330 .. -7 .. yheI b3331 .. -7 .. yheJ b3332 .. 12 .. yheK b3333 .. -27 .. pshM b3334 .. 0 .. hofD b3335
0.074030	285	+	rpiB b4090
0.074024	334	+	ycdT b1025
0.073870	137	+	yhdV b3267
0.073055	118	-	ydeK b1510 .. 44 .. b1509 b1509
0.072172	68	-	gatY b2096 .. 29 .. gatZ b2095 .. 10 .. gatA b2094 .. 31 .. gatB b2093 .. 4 .. gatC b2092 .. 48 .. gatD b2091 .. 100 .. gatR_2 b2090
0.071615	220	+	yhjE b3523
0.070959	80	+	pfkB b1723 .. 101 .. b1724 b1724 .. 106 .. b1725 b1725
0.070689	47	+	b2659 b2659 .. -46 .. ygaF b2660 .. 23 .. gabD b2661 .. 14 .. gabT b2662
0.070661	206	-	yieP b3755 .. 23 .. yieO b3754
0.069815	56	+	yhaG b3128 .. 149 .. sohA b3129 .. 0 .. yhaV b3130
0.069532	188	-	cirA b2155
0.068918	409	+	yihI b3866
0.068862	137	-	ybdN b0602 .. -27 .. ybdM b0601
0.068785	266	+	ycbQ b0938 .. 83 .. ycbR b0939 .. 25 .. ycbS b0940 .. -9 .. b0941 b0941 .. 12 .. b0942 b0942 .. -40 .. b0943 b0943 .. -34 .. ycbF b0944 .. 111 .. pyrD b0945 .. 138 .. ycbW b0946
0.068689	251	+	yicK b3659 .. 111 .. yicL b3660
0.068108	46	-	glmU b3730
0.067781	151	+	gmhA b0222
0.067613	113	+	elaD b2269
0.067438	113	+	yiiG b3896
0.067268	89	-	b2760 b2760 .. -7 .. ygcK b2759 .. 13 .. b2758 b2758 .. -3 .. b2757 b2757 .. -13 .. b2756 b2756 .. 16 .. b2755 b2755 .. -64 .. ygbF b2754
0.066910	270	+	nupC b2393 .. 81 .. yi81_3 b2394